苹果指出，新的iTunes 7.1软件解决了一些Windows Vista兼容性问题，但仍有一些大问题没有解决。苹果正在和微软积极合作，以解决剩下的那些问题。
同时，想要在Vista系统中运行iTunes的用户还需要注意一些严重问题。其中一个已经是老生常谈了：通过Vista的“安全拔出硬件”从PC中拔出苹果的iPod数字音乐播放器，可能会导致iPod损坏。
苹果表示，用户必须通过iTunes软件内部的“拔出iPod”功能才能确保安全拔出iPod。苹果还警告，iTunes 7.1可能会在运行于安装Vista的台式机或笔记本的时候错误显示文本和图像。另外，Windows的通讯簿可能无法和iPod同步。iTunes和64位版本的Windows Vista仍然完全不兼容。
